产品名称 | 产品编号 | 规格 | 储存 |
Quant TaqTM One Step RT-qPCR Probe Kit with UDG V5 | SYT107 | 2×1.25ml | -20℃避光 |
产品描述
ABScript III One Step RT-qPCR Probe Kit with UDG V5 是采用探针法进行 RT-qPCR 反应的通用款试剂盒。本试剂盒以 RNA为模板,使用基因特异引物,逆转录和 PCR 反应可在同一管内连续进行,不需要额外的开管、移液等操作,大大提高了检测通量。本试剂盒引入 dUTP/UDG 防污体系,热敏感 UDG 在室温下就可将含 U 的污染物迅速降解,50℃逆转录时热敏 UDG 迅速失活,不会影响 RT-qPCR 的效率和灵敏度。本反应体系可以对扩增产物进行实时检测,大大提高了检测灵敏度,并且省略了 PCR 反应后的电泳步骤,非常适合于 RNA 病毒等微量 RNA 的检测。本制品使用适合 RT-qPCR 的新型逆转录酶 ABScript III ReverseTranscriptase 高效合成第一链 cDNA,搭配使用探针和 TaqDNA Polymerase,配合经过优化的缓冲体系,具有高扩增效率和高扩增灵敏性,能稳定高效的进行一步法 RT-qPCR 反应。
适用机型
不需要使用Dye仪器机型 | Bio-Rad CFX96™, CFX384™, iCycler iQ™, iQ™5, MyiQ™, Opticon®, Opticon 2, Chromo4™; MiniOpticon™, Cepheid SmartCycler®; Eppendorf Mastercycler® eprealplex, realplex 2s; Illumina Eco™ qPCR; Qiagen/Corbett Rotor-Gene® Q, Rotor-Gene® 3000, Rotor-Gene® 6000; Roche: LightCycler® 480, 96, Nano, 1.5/2.0**; Thermo Scientific PikoReal Cycler. |
使用Dye I仪器机型 | Applied Biosystems: 7500, 7500 Fast, ViiA™7, QuantStudio 6 and 7 Flex System, QuantStudio 3 and 5; Agilent Stratagene: MX4000™, MX3005P™, MX3000P™. |
使用Dye II仪器机型 | Applied Biosystems: 5700, 7000, 7300, 7700, 7900, 7900HT, 7900HT Fast; StepOne™, StepOne Plus™. |
运输与保存方式
冰袋运输。-20℃避光储存,有效期 18 个月。
本品避免反复冻融。产品中含有荧光染料 SYBR Green I,保存或配制反应体系时需避免强光照射。
注意事项
1、. 解冻后Master Mix 可能出现絮状物质,4℃放置并上下颠倒混匀至溶液澄清,不影响试剂性能。
2. 、为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
反应体系(推荐冰上配制)
组分 | 体积(μl) | 体积(μl) | 终浓度 |
Quant TaqTM One Step RT-qPCR Probe Kit with UDG V5 | 10 | 25 | 1× |
Forward Primer (10 μM) | 1 | 0.4 | 0.2 μM |
Reverse Primer (10 μM) | 1 | 0.4 | 0.2 μM |
50×ROX Reference Dye I/II | 1 | 0.4 | 1× |
模板 DNA | X | X | - |
无菌超纯水 | to 20 | to 50 | - |
【注】: 使用前务必充分混匀,避免剧烈震荡产生过多气泡。
a)引物浓度:通常引物终浓度为 0.2μM,也可以根据情况在 0.2-1.0 μM 之间进行调整。
b)模板浓度:如模板类型为未稀释 cDNA 原液,使用体积不应超过 qPCR 反应总体积的 1/10。
c)模板稀释:cDNA 原液建议 5-10 倍稀释,最佳模板加入量以扩增得到的 CT 值在 20-30 个循环为好。
d)反应体系:推荐使用 20μl 或 50μl,以保证目的基因扩增的有效性和重复性。
e)体系配制:请于超净工作台内配制,并使用无核酸酶残留的枪头、反应管;推荐使用带滤芯的枪头。避免交叉污染和气溶胶污染。
扩增程序(两步法)
循环步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
预变性 | 95℃ | 3 min | 1 |
变性 | 95℃ | 5 sec |
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| 40-45 |
退火/延伸 | 60℃ | 30-34 sec★ |
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熔解曲线阶段 | 仪器默认设置 | 1 |
【注】: 延伸时间根据qPCR仪所需数据采集时间自行调整:使用StepOnePlus请设定为30s,使用7300请设定为31s,使用7500请设定为34s。
结果分析
定量实验至少需要三个生物学重复。反应结束后需要确认扩增曲线及熔解曲线。
1) 扩增曲线:标准扩增曲线为S 型。
Ct 值落在 20-30 之间时,定量分析最准确;
Ct 值小于 10,需要将稀释模板后,重新进行实验;
Ct 值介于 30-35 之间时,需要提高模板浓度,或者增大反应体系的体积,以提高扩增效率,保证结果分析的准确性;
Ct 值大于 35 时,检测结果无法定量分析基因的表达量,但可用于定性分析。
2) 熔解曲线:
熔解曲线单峰,表明反应特异性好可以进行定量结果分析;若熔解曲线出现双峰或者多峰,则不能进行定量分析。熔解曲线出现双峰,需要通过 DNA 琼脂糖凝胶电泳判断非目标峰是引物二聚体还是非特异性扩增。
如果是引物二聚体,建议降低引物浓度,或者重新设计扩增效率高的引物。如果是非特异性扩增,请提高退火温度,或者重新设计更高特异性的引物。
引物设计指南
1.、 推荐引物长度 25 bp 左右。扩增产物长度 150 bp 为佳,可以在 100 bp-300 bp 内选择。
2.、 正向引物和反向引物的 Tm 值相差不宜超过 2℃。引物 Tm 值 60℃-65℃为佳。
3、. 引物碱基分布要均匀,避免出现连续的 4 个相同碱基,GC 含量控制在 50%左右。3’端最后一个碱基最好为 G 或 C。
4、. 引物内部或者正反两条引物间最好避免出现有 3 个碱基以上的互补序列。
5、. 引物特异性需要用 NCBI BLAST 程序进行核对。避免引物 3’端有 2 个碱基以上的非特异性互补。
6、. 设计完成的引物需要进行扩增效率的检测,只有具备相同扩增效率的引物才可用于定量比较分析。